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北京城的官民听到袁世凯进京，都高兴得不得了，纷纷赶到车站迎接。袁世凯下车后，坐上轿子到了正阳门，庆亲王和徐世昌早就等候在那里了，双方互相寒暄几句后便一同去了摄政王府上。这摄政王府是载沣的府邸，但是眼下这个时候，载沣只能不计前嫌，殷勤款待袁世凯，盼着袁世凯能够力挽狂澜，拯救清廷。袁世凯却一脸深沉，假装谦虚，急得载沣冷汗直冒，只差没下跪求他了。庆亲王和徐世昌则在一旁对袁世凯又是劝又是奉承。
最终，袁世凯终于答应上任了。新官上任三把火，袁世凯虽不是“新官”了，但他一上位，就立马动手组织内阁，选用梁敦彦、赵秉钧、严修、唐景崇、王士珍、萨镇冰、沈家本、张謇、唐绍仪、达寿等人担任内阁成员，又在各省的宣慰使里挑选了几个有用的。您想想，在这四面楚歌的年代，还能有谁敢担此大任？京中还在职的那是没办法，北京城里的其他人都快逃光了！如今海军舰队、长江水师都归附了民军，其他地方也陆续独立，现在只有直隶和河南两个省没有变动，可以说大半个中国都已经被民军抢占了。
京中人少，民军人多势众，京中的人只好到处躲藏，全没了当年的威风。袁世凯这时已经是内阁总理，他接到警报后觉得民军太过嚣张，就想：如果不严惩的话，怕是不会有人把他袁世凯放在眼里，满人、民军都必须在我袁世凯的手中！
计划已定，袁世凯便与庆亲王商议，向隆裕皇后逼出慈禧的积蓄和国库的钱。袁世凯把银两都发到湖北，大大奖赏了冯国璋的军队，并命令他们攻下汉阳。冯国璋得到袁总理的命令后，比得到皇帝的圣旨还开心，立即鼓舞部下全力争夺汉阳。
汉阳民军总司令黄兴是湖南长沙县人，他极力主张革命，所以百折不挠。黎元洪之前没见过黄兴，黄兴到了武汉后主动去拜见黎元洪，并请命到汉阳对抗冯国璋。当夜，黄兴渡江到了汉阳，汉阳已经跟清军鏖战了好几天，死伤惨重，正在四处招募新兵。但是，新军没有经验，进攻不讲战略，场面一片混乱。
幸好冯国璋还没有接到袁世凯的命令，不敢轻举妄动，一时间两军相持不下。等袁世凯的命令一到，冯国璋立马下令围攻龟山。黄兴总司令抵达龟山后，连续打了两天两夜也没分出个胜负。
这时，冯国璋灵机一动，他换好衣服趁着夜色来到了江的另一边——汉阳，然后用大炮轰击民军。汉阳民军猝不及防，败下阵来。黄兴急忙赶到汉阳支援，但要害已被清军占领，他只好仓皇逃往武昌。龟山没有了司令，很快就被冯国璋拿下了。汉阳失守，等武昌的援军赶来时已经来不及。黎元洪后悔不已，只好把汉阳剩余的兵力收编到武昌的军队，尽力守住武昌。黄兴见了黎元洪后痛哭流涕，说自己想去东边借兵来支援，黎元洪便随他去了，但心中却不免叹息：黄兴带兵确实不行！
捷报传到清廷，冯国璋立刻被封为二等男，他得意洋洋地要乘胜追击武昌，再得一个晋升的机会。于是他派重兵在龟山架起机关大炮，轰击武昌。武昌跟汉阳只隔着一条江，在射程之内，但幸好武昌防守严密，损伤不是很大。只可怜了那些逃难的汉民，不少人在逃难路上被炮弹击中掉进水里，残肢断臂都随水流走，很多妇女儿童甚至还来不及求救，就进了鱼鳖的肚子。冯国璋也真下得了手！
各国领事看到这般惨状都愤愤不平，他们推选英国领事去劝战。中国同胞居然落到了自相残杀，还要外国人劝架的地步，真是可悲啊！可冯国璋怎么也不肯罢休，还说自己只听清廷的命令，炮火也不肯停，连轰了三天三夜，直到接到袁世凯的命令才停手。冯国璋又向英国领事提出条件说，民军都是土匪，他们必须退到武昌十五里以外，而且还要缴械，把枪炮都交给英国领事代为保管。领事把消息转达给黎元洪，黎元洪随即召来各省代表一起商量。
原来宣布独立的省份都选出代表在武汉组建了临时政府，代表们见了冯国璋的停战条款都气愤得不行，决定不给他答复。但他们又怕英国领事面子上过不去，于是提出清军也必须退到汉口十五里以外，霸占的火车也应交给英国领事的条件。多么滑稽的答复，这种矛盾的调停怎么收场呢？冯国璋已经接到了停战的命令，他不好再多说什么，只好停了炮火，乐得自在。这时江南传来急电，南京已经被民军占领，张人骏、张勋等人弃城逃走了。袁世凯停战十五天的命令也传来了，冯国璋只好驻守在江边按兵不动。
江督张人骏原本也是个人物，但他是满人，始终为清廷卖命。张勋虽说是汉人，但是清廷十分厚待他，他不敢忘恩，只能与民军作对，所以各省都独立了，南京却依然服从清廷。
江南第九镇统制徐绍桢已经决定反抗清廷了，他担任宁军总司令发兵攻打南京，初次失败后退回了镇江，等浙军、孙军等多支军队集合到一起后，再一同攻打南京。
张勋也是个有能耐的人，他带着十八营防军与联军打了好几次，双方互有损伤。但联军从多方进攻，张勋再厉害也难免顾此失彼，抵挡不住，只好向袁世凯请求支援，没想到袁世凯竟然不理他。
没过多久，紫金山、天保城等地相继失守，张勋只好带兵退到朝阳门，只留下一部分狮子山的兵力开炮轰击联军。哪里知道狮子山的兵早就变心了，炮打的都是空气，紧接着城外最要紧的雨花台也被占领了。张勋没有办法，只好叫爱妾收拾东西，连夜跟张人骏、铁良等人从汉西门逃跑。联军进到南京城里，百姓们欢呼雀跃。
南京处于长江下游，依山傍水，以前是龙盘虎踞的都城，所以民军必须占领南京作为根据地。现在清军占领汉阳，民军夺下南京，两军打成了平手，议和也就不了了之了。这一切都在袁世凯的意料之中！
袁世凯与摄政王载沣的关系也只是表面功夫。南京失守，袁世凯就把责任推给载沣，想借机把载沣逼回藩地。载沣怎么担待得起这么大的责任呢？所以自愿回藩地去了。庆亲王虽然不是总理了，但每次重要会议都要请他参加。庆亲王也一直在隆裕皇后面前力保袁世凯，隆裕皇后毕竟是女流之辈，虽然心里明白袁世凯未必可靠，但也只能把权力全部交给他。
袁总理又叫来尚书唐绍仪秘密商量了一整晚，接着派他做代表赶往南方议和。民军这边也派出伍廷芳做代表，双方约定在上海见面。但结果只约定了停战，没说言和的事情。这时，革命党的首领孙文从海外回来担任临时总统了。
孙文，字逸仙，号中山，广东香山县人。他小时候在教会学校念书，吸收了不少西方文化，眼见清朝政府日益腐朽，便主张革命。后来又四处留学，认识了很多中国留学生，组织了同盟会，一心跟清廷对抗。在此期间，孙中山开展了好几次革命运动，可惜统统失败了。直到民军起义占据了中国三分之二的版图，他又燃起了希望，赶忙回国。您想想，中国革命都是孙中山先生一人发起的，这时衣锦还乡国人能不欢迎吗？
之前黄兴到上海想让江、浙两军去支援湖北，刚好在这儿遇上清军议和停战，支援的事情就先放下了。南京已经攻下，各省的代表都从汉口来到南京，准备选出正副将军，为以后选总统做准备。公开选举黄兴的票数最多，当下当选为大元帅，黎元洪票数第二，当选为副元帅。这个结果让江、浙两军都不服，他们认为汉阳失守多半是黄兴的责任，他怎么能当大元帅呢？而且黎元洪是对革命有功的第一人，怎么能让他的位置在黄兴之下？众人发电报到上海表示不服。代表们没有办法，只好商量把两人的位置互换。
黄兴听说联军不同意选举结果后，就离开了上海，他给各省的代表写信推选黎元洪为大元帅。这下众人满意了，只是黎大元帅现在人在武昌，副元帅只能暂代大元帅，临时政府就这样组建起来了。代表们还在南京设置了元帅府，等着黄兴上任，没想到请了几次，黄兴都拒绝了。有几个革命党人一向跟黄兴交好，他们跑到代表会所拍着桌子说：“选好了的正副元帅，怎么能说换就换，想必一定是你们看不起我们吧！亏你们还是代表，自己设身处地地想想，一个大元帅突然被降职，谁还会有脸面来这儿组建临时政府？”一席话说得代表们都哑口无言，连忙安慰他们，革命党人这才离开。
代表们后来一直忍气吞声，直到接到孙中山已经到了吴淞口的消息这才安心，心想这下总算有能解围的人了。随即准备了欢迎会，其他的先不管，一心一意地推选孙中山为临时大总统。初十那天开会投票，各地代表加起来一共十七个人，十七票有十六票投的是孙中山。大局已定，大家大声欢呼着：“中华共和万岁！”
这是中国大陆开天辟地的第一次创举。孙中山无法推辞，于是宣布在1911年1月1日上任。这天也是中华民国纪元的吉日。
话说中华民国元年一月一日那天，孙中山坐上专车赶到南京就职，火车上到处挂着五色旗，随风飘扬。五色旗象征着民族共和，后来被定为国徽。武昌起义用的是十八星旗，四川、贵州、广东、广西独立后用的是青天白日旗，之后各省独立通用白旗。
这天中午，孙中山的车子到了南京，社会各界的人物都跑来车站迎接，在南京的各国领事也都来了。一时鞭炮齐鸣，表示热烈欢迎。孙中山下车后坐马车到了临时总统府，在当天就举行了就职礼。各省代表和海陆两军的代表也都来齐了，军乐声与欢呼声合成了一片。等现场声音小点了，孙中山宣读了誓词：
倾覆满洲专制政府，巩固中华民国，图谋民生幸福。此国民之公意，文实遵之，以忠于国。至专制政府既倒，国内无变乱，民国卓立于世界，为列邦公认，文当解临时大总统之职，谨以此誓于国民。
等孙中山宣誓完毕，各代表捧出了大总统的印信，让孙总统完成就职仪式。经过推选，已经担任南京总司令的徐绍桢宣读了宣言。