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嬴政少年即位，还不具备处理国政的能力。因此，秦国朝政由太后赵姬和相国吕不韦执掌。这时秦国的大事实际上操纵在吕不韦一人的手中。
公元前241年，楚、赵、魏、燕、韩五个国家又一次联合起来抵制秦国扩张。他们推举楚王为“盟主”对秦军予以反击。吕不韦面对这种境况，决定采用重点打击，分化六国连纵的方法，使得六国联军瓦解。秦国于是开始憎恨楚国这个“盟主”。
吕不韦明白要削弱或灭掉楚国，一定要除掉楚国的智囊春申君。于是百般刁难楚国，楚国国王不免会迁怒于提出计策的春申君。春申君为了平息楚王的怒火，四处网罗美女来供楚王享乐。说来奇怪，春申君送入楚宫的女子甚多，加上原有的楚国妃子，楚国后宫充盈，但楚王却一直没有子嗣。春申君一筹莫展。
有一天，春申君的宾客李园求见春申君。事后将自己的妹妹献给了春申君。不久，李园的妹妹怀孕。一天李园的妹妹趁着春申君为楚王无子而烦恼的时候，向春申君提出了“保证能长久宠于国君”的良策。这就是将怀了身孕的自己送到楚王身边。
有人传说，李园是吕不韦派去楚国的奸细，出这个点子的就是吕不韦。就像传说中吕不韦当初让自己的爱妾赵姬怀孕嫁给异人一样，故伎重施，因为李园及其妹妹都是赵国人。而吕不韦的基业在赵国建立，他的食客也多数是赵国人。
后来，李园的妹妹确与楚王结合后生下了儿子。楚王自然高兴，封李园的妹妹为皇后，封小王子为太子。此后，李园鸡犬升天，受宠程度超过了春申君。楚王死后，李园成功除掉了春申君，直接控制了楚国的政权。吕不韦借着李园之手除掉了秦国的眼中钉。这是嬴政初登王位时，吕不韦为嬴政削弱楚国所做的一件大事。
吕不韦在位期间，对韩、赵、魏三国进行了比较集中的攻击。嬴政五年，在吕不韦的帮助下，秦国在靠近齐国的魏地成立了东郡，这样秦国就有了与齐国接壤的地区。
秦国可以凭借这一地区直逼关东各国。这场战役由秦国大将蒙骜率领秦军大举进攻魏国，攻占了酸枣、桃人、雍丘等地而完成。这对魏国国都大梁造成了严重威胁。
第二年的时候，秦军又占领了魏地朝歌和濮阳，并把濮阳并入东郡来管理。这一下可引起了各诸侯国的惊恐。东郡不但与齐国接壤使齐国开始惴惴不安，而且也把六国割裂成南北两部分。六国再想连纵抗秦，简直是困难重重。
吕不韦很有战略眼光，他知道这些年来，秦国因为六国联合吃了不少败仗，所以秦国要取得六国就要破坏几国的连纵。经过吕不韦十年的征战讨伐，秦国大幅度地削弱了六国的势力。
吕不韦不仅有治国的才能，也有任人唯贤的气量。他手下养了三千食客，为秦国网罗治国英才，后来的丞相李斯就是出于吕门，而他最为出名的用人策略是甘罗拜相。
在嬴政还是秦王的时候，秦国与燕国结盟，秦国要派人到燕国当相国。吕不韦想启用张唐。张唐死活不答应，谁愿意到一个穷沟沟里当什么相国，万一秦国和燕国打起来，老命都不保了。
回到家中，吕不韦闷闷不乐，甘罗看到了就询问吕不韦原因。甘罗是秦将甘茂的孙子，也是吕不韦的宾客。吕不韦就原原本本地将这件事告诉了甘罗。
甘罗听了，便呵呵一笑说：“相爷，这事就交给我吧！我能劝服张唐去燕国。”吕不韦一开始还有一些不太相信，便说：“你若能劝服张唐，我就拜你为上卿。”甘罗胸有成竹地找到张唐，开门见山地问：“先生，我与白起的功劳哪个大？”张唐说：“这还用问吗？当然是甘罗大。”甘罗又问：“文信侯与当年的范雎谁的权力更大？”张唐说：“自然是文信侯的权势大！”甘罗笑笑说：“当年白起攻打赵国范雎不肯，结果逼得白起自杀，现在文信侯要您去燕国，您却推辞不去，这样做岂不是很危险吗？”这下可把张唐吓傻了，便答应去燕国做相国。
甘罗回到相府，将事情的原委同吕不韦交代清楚。并对吕不韦说：“张唐去燕国不是出于自愿，我们不能大意，您不如先派我去趟赵国。”吕不韦领略了甘罗的才华，便答应他去赵国。
赵王正在为秦、燕联盟的事而愁苦，听说秦使来到赵国，急忙迎接。等接到一看，竟是个小孩子。赵王惊讶地问：“你今年多大了？”甘罗说：“12岁。”赵王又接着问道：“难道秦国没有年纪稍微大些的使者吗？怎么会派你来呢？”甘罗丝毫不示弱：“我们秦国的用人原则是，年龄大的人办大事，年龄小的人办小事。我最小，自然派我来赵国了。”
赵王一听不敢再小觑甘罗。于是恭敬地问：“先生来到我们国家是为了什么呢？”
甘罗说：“大王您知道我们国家与燕国结盟的事了吗？”
赵王说：“是的。”
甘罗又接着说道：“秦、燕两国结盟，这对赵国是极为不利的，这个您清楚吗？”
赵王点头：“那您认为应该怎么办呢？”
甘罗微笑着说：“秦燕结盟不过是想扩张河间的地盘，若您能拿出河间五城交给秦国，那么，我可以说服秦王不与燕国结盟，而与赵国联盟。这样，赵国就可以攻打燕国了。”
赵王一想也是，如果秦、燕两国联合作战，河间是肯定保不住的。与其这样还不如以献河间五城来求得安宁。于是，他便将河间五城交给甘罗带回了秦国。
甘罗回到秦国将在赵国得到五城奉到秦王面前，秦王高兴地说：“你的智慧比你的年龄要高出很多啊！既然这样就不要让张唐去燕国了，我们与燕国绝交，派兵攻打燕国。”这样燕国的30座城又落到秦国手里。赵国又把11座城池献给了秦国。
此后，秦王拜甘罗为上卿。秦王的善于用人，固然与秦王的远大抱负和魄力有关，但也不无吕不韦的关系。如果没有吕不韦的信任和推荐，甘罗纵使有千般能耐也无法脱颖而出。
吕不韦用人不避年少，使得秦国家家望子少有所成。其他国家的人才看到吕不韦这样慧眼识珠，也纷纷前来投靠，这进一步壮大了秦国的人才队伍，为秦国的强大做出了贡献。
也是由于吕不韦广纳人才，秦国宫中与吕不韦有裙带关系的人数众多，吕不韦形成了庞大的势力。这庞大的势力严重威胁到嬴政的统治，造成了嬴政沉重的心理负担，再加上吕不韦得意忘形，编写了《吕氏春秋》为自己歌颂功德。
全书贯彻了吕不韦的思想文化观念及政治主张。《吕氏春秋》综合了各家学说之长，指导秦国统治阶级兼并六国，建立大一统的封建王朝，并实现长治久安。
它对各家学说实际上是有所吸收，有所扬弃，主要是吸收其中比较合理、进步和有利于实现上述目的的内容。因而它是“杂而不杂”，宗旨明确。《用众》篇说：
天下无粹白之狐，而有粹白之裘，取之众白也。……故以众勇无畏乎孟贲矣，以众力无畏乎乌获矣，以众视无畏乎离娄矣，以众知无畏乎尧舜矣。夫以众者，此君人之大宝也。
《吕氏春秋》对先秦各家各派着重审视其优长，偏重于汲取其精粹，力图超出门户之见，它说：
老耽贵柔，孔子贵仁，墨翟贵兼，关尹贵清，列子贵虚，陈骈贵齐，阳生责己，孙膑贵势，王廖贵先，儿良贵后，此十入者，皆天下之豪士也。
由于《吕氏春秋》有这种兼容并包的眼光，所以能取精用宏，融汇百家，以道贯之。
《吕氏春秋》继承发扬了道家齐万物思想，认为“一则治，异则乱；一则安，异则危”。思想统一后，才能“齐万不同，愚智工拙，皆尽力竭能，如出一穴”。统一的过程，实际上是一个批判吸收的过程。
所以，《吕氏春秋》对各家思想都进行了改造、发展与摒弃。例如，儒家主张维护君权，这种思想被《吕氏春秋》吸收了，但它是以独特的面貌出现的：主张拥护新“天子”，即建立封建集权国家。
《吕氏春秋》主张的是兴“义兵”，“义兵至，则邻国之民，归之著流水，诛国之民望之若父母，行地滋远，得民滋众，兵不接刃，而民服若化。”
《吕氏春秋》中认为，一味地反对战争是没有意义的，并且也是不对的。正义的战争，也就是“攻无道而伐不义”的战争，不仅可以除暴安良，而且还可以得到人民的衷心拥护。这实际是为秦国统一中国的战争进行辩护。
《吕氏春秋》的问世令嬴政内心的妒意与担忧越发深重了。找到机会清除吕不韦在秦国的势力是嬴政一直在探求的。因此，两个人开始在暗地里较量。
有一次，吕不韦向秦王嬴政上奏道：“王既已掌天下，应当大赦天下罪人，使万姓欢悦。”
嬴政摇头一笑，回吕不韦说：“相国，罪人只能坐牢，不能赦！”
秦王坐上王位后，凡事皆亲政。吕不韦觉得秦王年幼，又自恃是前辈，事事都要发表自己的高见，可是这样让嬴政很不愉快，他下定决心给吕不韦一点儿警告。
有一天，朝贺过后，嬴政命黄门摆酒，邀请吕不韦进宫坐饮，说道：“相国，你是本王的仲父，本王敬相国如敬父母。仲父年纪大了，应好好地在府中享乐，朝堂之事，少操些心。”
吕不韦自然不情愿退居，于是便慷慨地说：“大王，我今年才39岁，正是少壮为国出力的年纪啊。待我王到了15岁以后，我自然什么也不闻不问了。”
嬴政嘻嘻地笑着，端着酒杯，说道：“相国，我和你猜枚，输一次，饮三斗。”
吕不韦说道：“哎呀！我的大王，你可不能过多饮酒。饮酒过多，戕害贵体。”
嬴政不以为然道：“我8岁那年就饮酒，我母后教我的。父王在时，也教我饮酒。”
吕不韦听到嬴政这样说，觉得嬴政现如今和往日不同，便不敢再多言。从此，在他心中便产生了前所未有的危机感。因为他与赵太后保持着非同一般的关系，日子虽然过得快活，但终究是见不得光的。这样偷偷摸摸的日子，吕不韦是不想再过下去了。
嬴政一天天地长大，吕不韦唯恐自己和太后赵姬的事情败露，那样后果将不堪设想，从而灾祸将会降临在自己头上。况且赵太后一天天年老色衰，吕不韦也厌倦了。但是，这也不是一件好办的事情，弄不好赵太后就会怀疑。
于是，吕不韦终于想出了一个金蝉脱壳的好办法，这就是找个替代品，而这个替代品就是嫪毐。于是，他把一向纵情声色的嫪毐收为了自己的门客。这显然是一招险棋，如果处理不好便会激怒太后，从而惹来杀身之祸。
嫪毐原本是个市井无赖，他偶然得到了一个偏方，试用奇效，至此开始了药贩生涯。后来，他和吕不韦家里的一个丫鬟熟络并私通，被发现后，他被召为吕相府中舍人。此时吕不韦正为脱离太后赵姬而烦恼，因此，嫪毐的出现为吕不韦彻底解决了这个焦灼的难题。
吕不韦经过一番努力，终于使得嫪毐引起了赵太后的注意，赵太后有意将嫪毐据为己有。这个时候的赵姬，或许也感到了吕不韦的力不从心，或许也是寻求新鲜、刺激的心理，加上她骨子里对男人的失望和不以为意，竟也不深究期中的原因。反正儿子即将长大成人，有了一定的见地和根基，她不用再操心了。
要得到嫪毐，并不是一件简单的事，当然要吕不韦想办法。怎样进入王宫就是个大问题。王宫禁卫森严，即使达官贵人也不能随便出入，更何况是平民百姓。吕不韦想到了要嫪毐冒充宦官进入宫中的做法。他与赵姬买通了主管宫刑的官员，将嫪毐送到赵姬身边，供赵太后享乐。嫪毐是有胡须的，因为没有净身，他的胡须会不断地长出来，每过几天嫪毐都要忍受短暂的痛苦，将自己的胡须清理干净。
就这样嫪毐开始侍奉赵太后，赵太后对嫪毐也是相当的满意。后来，竟然怀了嫪毐的孩子，她恐怕别人知道，于是便假称算卦不吉，需要换一个环境来躲避一下，就迁移到了雍地的宫殿中居住。从此，嫪毐终于富贵发达，不但被封为长信侯，还和太后赵姬生了两个儿子。
嫪毐封侯之后，以山阳为他的居住地，以河西太原郡为他的封地，所得赏赐丰厚异常，雍城的一应事情取决于嫪毐，宫中事无大小也都取决于他，家中童仆宾客多至数千人，投奔嫪毐求官求仕的宾客舍人也有千余人，一时门庭若市，成为咸阳豪门。
嫪毐果然不负所托，如今已经发展成了能与吕不韦抗衡的势力。同时，嫪毐与吕不韦也势同水火。嫪毐与太后一起密谋，一旦秦王去世，就由他们的儿子继承王位。
但是，嫪毐毕竟是市井小人，小人得志，难免会忘乎所以，往往得意妄言。有一天，嫪毐与王公大臣们饮酒赌博，醉酒之后，与人争执起来。只见他圆瞪双目，大声呵斥道：“我是当今国王的继父，你这穷小子竟然敢与我对抗！”
争执者听后赶紧就逃走了，然后把这话报告给了秦王，说：“嫪毐实际上不是宦官，他与太后私通，已经生下了两个儿子，而且他还密谋让自己的儿子继承王位。”
嬴政听到这个消息，不禁愤怒异常，立即派官员调查虚实，想尽快把事情真相全部弄清楚，后来得到密报，说嫪毐本来不是阉人，确与太后有奸通且生子的丑事，而且这件事情还牵连到相国吕不韦。但他并没有立刻采取行动。
秦王政九年，也就是公元前238年，嬴政21岁。按照礼仪，他必须在祖宗的宗庙里接受冠礼。这是长大成人的标志。秦国的宗庙在雍城，那是秦国过去的都城，历代秦王在这里经营了将近300年，宗庙都在这里。秦王从咸阳来到雍城，举行了冠礼仪式。他头戴王冠，身佩长剑。这意味着他即将亲理朝政。
这时，有人把秦王派人调查的事情告诉了嫪毐。嫪毐十分惶恐，自从他被封为长信侯以后，又得河西太原郡为毐国。他恣意享受着宫室车马衣服苑囿，过着优裕的王侯生活，他怎么能突然失去这一切？于是，嫪毐决定铤而走险，先发制人，利用秦王在雍城的机会发动叛乱。
这一天，趁着嬴政宿雍城蕲年宫行冠礼，嫪毐便偷取了秦王御玺和太后玺，召集部分地方士兵、宫中侍卫、骑兵和自己的门客，企图攻打嬴政在雍城的行宫蕲年宫。
秦王嬴政听到消息，立刻采取了果断措施，命相国昌平君、昌文君领咸阳士卒平息叛乱，两军战于咸阳。吕不韦假冒秦王下令：“凡有战功的均拜爵厚赏，宦官参战的也拜爵一级。”
嫪毐的三千龙虎兄弟，每人一把锋利的长剑，一个大盾牌，一条长戈，一匹好马，轰隆隆冲出府来，其声如吹怪树，如滚巨石，所有反者，心中都只有一个目标，那就是秦宫。
这时，相国昌平君、昌文君指挥七千铁骑，从咸阳西城三门如狂风一般扫入城中，当秦军的前锋，杀到朱雀大街中心时，正遇上嫪毐的先头部队，嫪毐反部尽是咸阳地区的亡命之徒。他们平日在咸阳市上，无恶不作，今天，他们更加猖狂。他们一遇上秦军，都发出如雷的恶声冲上去。
血战即盘天绕地地开始了。嫪毐拿着一柄剑，东劈一下子，西划一下子，没有伤着人。后来，昌平君、昌文君的兵马一层层地逼攻上来，嫪毐所率的亡命之徒，一个又一个地翻下马去。嫪毐亲眼望见，凡是中了戈、戟、矛、剑的人，都是身上一颤，接着就“啊呀”地一声落下马去，再也不动了。
这时，秦王嬴政率领着又一路军队赶到，直把嫪毐之众击退半里多地。将军蒙恬，一支神戟，龙马践踏处，这些反秦的狂奴，接二连三地坠下马鞍，人马都被鲜血喷成赤色。秦王嬴政手拿着宝剑，杀入敌阵，一干众将护着他那万乘之尊，他高呼杀声，毛发皆动，战马狂嘶。
五百多亡命徒一声喊叫，都冲上来，把嫪毐护在中心，退向东方，又西向北拐，逃出咸阳北门。一路上他叫道：“我平日所练家将，甚是精悍，为何今日一遇秦王之师，都如兔子见高空之鹘？可恨蒙氏弟兄，为王卖力不懈。”
事实上，嬴政也早已对他母亲的情人恨之入骨，便令谕全国：“生擒嫪毐者赐钱百万，杀死嫪毐者赐钱五十万。”
不久之后，嫪毐的死党全被秦军的剑、斧、戈、戟镇伏下去。映着初升旭日的金光，秦王嬴政跃马横剑，被蒙武接入秦阳门。宫中欢声雷动，钟鸣鼓响。
这场战争，嫪毐的1万徒众，死伤3000多人，秦军也死伤了2000多人。嫪毐的门客、好友，被斩首300余人。所余叛众，尽皆降伏乞命。
后来，嫪毐和他的一批死党在咸阳东50公里的地方被当地县令率兵擒住，押入咸阳。这天，嬴政在殿前设座，左有相国昌平君、昌文君，右有李斯，还有满朝文武官，共计500多人。
嬴政看了一眼李斯，把手一挥，李斯向众官宣布嫪毐罪状道：“私隐大阴，秽污宫禁，滥冒忠号，欺骗圣主。又且聚众反天，干戈已逞，震动咸都，攻劫王驾，罪在不赦。曷可罔极，令五车挣之，以裂天下同类之胆，以广我王慑服众丑之天威！”
李斯念完罪状，赵高便大声喝道：“车裂之刑开始！”伴随着一声惨叫，嫪毐瞬间被四分五裂，鲜血四溅。
这时，文武百官一齐向嬴政跪下祝贺，但听钟鼓齐鸣，阶下四千宫卫军如豹吼般震天动地的一声喊：“祝我王万寿无疆！”
嬴政这时面带微笑，立起身宣旨：“昌平君、昌文君俱赐黄金万锭，增禄粟二千石；李斯晋为廷尉；蒙武晋大将军；蒙恬、蒙毅俱晋将军。”其余论功者，皆拜爵，宦者随蒙武守卫宫禁入战者，亦皆拜爵，赏赐有差。
嫪毐被嬴政彻彻底底地铲除掉了，这不仅仅是因为他与赵太后之间的事情，其实还包含着更深层的政治原因。嬴政是秦王，他必须要维护王位，从而取得政治上的独立。如果嫪毐没有染指政治，那么，即使他淫乱后宫，嬴政也可能饶嫪毐一命。毕竟生母还在，假父亲对生母有用，对自己无害。
但是，嫪毐不但染指了政治，甚至还生下了两个来争夺王位的小子。还大言不惭地说要在秦王百年之后继承大位，使江山易主。这样嬴政自然是不会放过他的。
如果嫪毐染指政治，只是安安分分地做个享受型的侯爷也就罢了，可是他却借着自己的势力，野心勃勃地想要取代吕不韦进而架空嬴政，这样，嬴政就不会置之不理。而且，要是除掉了他，嬴政自然在文武百官面前的势力也会大大增强，也想借此来灭一下吕不韦的嚣张气焰，让他能摆正自己的位置。
嬴政在捉拿嫪毐之乱参与者的时候，他发现其中竟然包含卫尉、内史、左弋、中大夫等高官。这说明当时的嫪毐已经具备了一定的政治势力。
嬴政的政治眼光是敏锐的。他选择在登基之后，大权在握之时，对嫪毐发动讨伐，是最好的时机。新官上任，要做出些成绩才能服众，才能杀一儆百，给他人一个震慑。可见，嬴政也不缺乏政治头脑。嬴政在等到嫪毐发动叛乱后，举兵灭杀，又派吕不韦剿灭嫪毐，足见嬴政的政治手腕。
对于太后的乱情，嬴政是早就有所耳闻的。只是这么多年来，母子相依为命，多少还有些感情在。自己又没有掌握实权，只能睁一只眼闭一只眼。
但是，这个赵太后也着实有些过分，生了两个孩子，而且还应允他们的两个儿子继承大位，这让嬴政感觉到了危机。赵太后在答应嫪毐将他儿子扶上大位之时，甚至没有考虑到嬴政和她之间的母子之情。
因此，嬴政在政治上和心灵上都受到了残酷的打击，他甚至不能相信自己的亲生母亲，自然也无法相信除了自己以外的任何一个人。故而他下定了除掉嫪毐的决心。
而太后和嫪毐的两个儿子，都被装进麻袋，活活摔死了。而对于自己的母亲，嬴政不能处分，只好将太后逐出咸阳，迁往城外的贡阳宫，软禁起来，就此断绝母子关系，永世不再相见。可是，软禁母亲，毕竟是一件大逆不道、不孝顺的事情。因此，有许多大臣都为此纷纷发表意见。
有一些人认为嫪毐祸乱秦廷，杀之、裂之皆为得当之法。但是有受过嫪毐恩惠的人，他们却暗议秦王嬴政：“车裂假父，有嫉妒之心；摔杀二弟，有不慈之名；弃母咸阳，有不孝之行。”
秦王政曾向群臣说过：“谁若轻议嫪毐、太后事，便用铁蒺藜骨朵杖杀之！”
因此，有人议论秦王道：“蒺藜杖杀，为桀纣之治。”这些议论者27个人，又形成了党羽，并向六国到秦国来的使者散发书简，尽言秦王政之过，以毁其威。这些人的行为被蒙武府中门客探知，报给蒙武。蒙武细查一番，果然是真，就密奏给秦王政。
秦王政特命蒙武尽快逮捕他们下狱。审问期间，他们27人要面见秦王政，自称：“有话要说。”
秦王政听了蒙武的回报，在偏殿重审那27人。那27人异口同声地道：“我们议论、发简，其事实有，但是为了老太后。她一个人呆在贡阳宫里，孤零零地，天下人不笑话天子吗？只有天子为太后的孝子，我们才能有忠于君之行，并非为嫪毐翻案也。”
嬴政冷笑道：“嫪毐欺骗寡人，祸乱家国，害人甚众，且又造反，寡人杀人，何为嫉妒？所谓二弟，乃嫪毐造孽，非我赢氏族属，留之必为后患，摔杀何为不慈？太后生活不谨，以金玉之躯，贱售于不法之徒，毁寡人之形象，幽之，何为不孝？凡是嫪毐党徒，寡人除恶务尽，乃为国家社稷之安定。立铁蒺藜骨朵以威之，有何不可？你们27人乃是嫪毐党徒，漏网之鱼，又在作祟，向六国使者散发寡人所谓的四大过错，欲为嫪毐复仇，非为国家也！你们尚有何说？”
27人当即语塞，难以对答。嬴政发作起来，便令蒙武把他们27个不明不白的多事之人押到廷尉李斯处，细审口供。那27人一齐承认：“是为嫪毐朋党。”
嬴政令蒙武到李斯那里宣旨：“一齐杖杀之，并向众臣宣传，凡是嫪毐党徒。皆无生路。”
李斯奉秦王政之令，把那27个人，都使大棒，先打烂了身子，后敲碎了脑袋。并把他们的尸首挂在宫墙示众。看到嬴政杀掉这么多的人，一时间，就没有人再敢进谏了。
这时，一位在秦国为客卿的茅焦挺身而出，他感慨地说道：“儿子囚禁母亲，这可真是天翻地覆啊。哪里有这样的道理？”接着，茅焦又自报家门说道：“我是齐国人茅焦，今天我是为了太后的事情特地来劝说大王的。”
这一次，茅焦很幸运，接到求见的报告，嬴政并没有立即处决他，而是派使者提醒说：“你难道没有见到那些因为来说太后的事儿被杀掉的人的尸体吗？”
茅焦回答：“我正是为此事而来。我听说天上有二十八星宿，如今已经有二十七个了，我来就是要凑够二十八之数。我不怕死！”那些和茅焦一起居住的人听说茅焦去谏止秦王，都认为他必死无疑，大家合伙把他的行李私自瓜分，各自逃亡了。
嬴政听到使者的回报后，火冒三丈，大怒道：“这小子是故意来违背我的命令的，赶快准备一口大锅，我要煮了他。”说完，他按剑端坐，气势汹汹，召见茅焦。
茅焦故意缓慢地进殿以减弱秦王的怒气。使者催促他快些走，茅焦说道：“我到那里也是会当即处死，您就不能让我慢些吗？”使者听了这话也不再催促他了，甚至为他感到悲哀。
这时，茅焦来到秦王嬴政的面前，不慌不忙地行过礼，对秦王说：“我听说，长寿的人不忌讳谈论死亡，国君不忌讳研究国家灭亡。人的寿命不会因为忌讳死亡而长久，国家不会因为忌讳亡国而保存。人的生死，国家的存亡，都是开明的君主最希望研究的，不知道大王是否愿意听呢？”
听到这里，秦王的怒气稍稍有些缓解，然后便问茅焦：“你说这话是什么意思？”
茅焦回答说：“忠臣不讲阿谀奉承的话，明君不做违背世俗的事。如今，大王有极其荒唐的作为，我要是不向大王说明白，那就是辜负了大王的期待。”
嬴政停顿了一会儿，说：“你要讲什么？说来听听。”
茅焦说：“天下之所以尊敬秦国，也不仅仅因为秦国的力量强大，而是因为大王是英明的君主，深得人心。现在，大王车裂你的假父，是为不仁；杀死你的两个弟弟，是为不友；将母亲软禁在外，是为不孝；杀害进献忠言的大臣，是夏桀、商纣的作为。如此的品德，如何让天下人信服呢？天下人听说之后，就不会再心向秦国了。我实在是为秦国担忧，为大王担心啊。”
说完之后，茅焦解开衣服，走出大殿，伏在殿下等待受刑。秦王政听了茅焦这番话之后，深受震撼，他知道自己的行为对收买人心、统一天下大业十分不利。
于是，嬴政亲自走下大殿，扶起了茅焦，说：“赦你无罪！先生请起，穿上衣服。我愿意听从先生的教诲。”
茅焦进一步劝谏说：“以前来劝谏大王的，都是些忠臣，希望大王厚葬他们，别让天下的忠臣寒了心。秦国正图一统天下，大王更不能有迁徙母后的恶名。”
秦王说道：“以前那些人都是来指责我的。没有一个向我讲明事关天下统一的道理。然而今天，先生说出来的话使我茅塞顿开，哪里有不听的道理？”
于是，秦王嬴政采纳了茅焦的建议，厚葬被杀死的人，又亲自率领车队，到雍地迎接赵太后，然后把赵太后接到福年阁居住。这时，秦王嬴政有命，凡后妃所居之殿、阁、楼、房，一律都改为宫。福年宫正屋中，几年无人居住，已是尘土蒙蒙，阴风历历，蜘蛛盘丝，卢蜂做蛹了。赵太后见此光景，一边令人收拾，一边泪流满面。
第二天中午嬴政到福年宫来见赵太后，心中也十分酸楚。赵太后先是哭，后来笑了，说道：“陛下不必伤心，哀家知你是孝子。那一年在邯郸，你才五岁，多亏吕相国买通赵国大将乐乘等人，我们才得以归国。
“我本想不回国，怕在路途成为累赘，连累于你。五岁的你牵着我的衣服，哭叫不止，说什么一生也离不开母亲。我只好抱着你，跟吕不韦逃到这咸阳来了。可知你如今还是那样儿。我年轻守寡，于人节有亏，自知不对，从此静守深宫，为天子的脸面争光。”
嬴政听后，热泪盈眶，说道：“母后回宫的事，还亏得大夫茅焦……”他随即把处置27人及听取茅焦之事，还有迎太后回宫的经过，诉说了一遍。最后说：“母后今后在宫中可随意享乐，若有不顺心的事，请向王儿说明，孩儿一定不使母后寡欢。”
赵太后于是说道：“茅君为秦之上卿，亢直敢言，而又不伤君臣、母子之大体，使秦国社稷得以安宁，是一个真正的上卿。陛下有福，得此明臣。”
嬴政接着又说：“母后不宜在福年宫居住，可免去若干枝节。几日后，移到秦阳门南隔街的内云阳宫。那里没有宫女、后妃、黄门的纷扰，也没什么诋毁母后的小人。内云阳宫中，林木荫厚，清水陶连，假山叠叠，名花艳艳，正宜母后养老。王儿我不时去探望母后，也不悖人伦之情。”
赵太后听到嬴政的安排之后大喜起来，从此，赵太后母子关系得以恢复。返回都城咸阳的太后非常高兴。于是，她摆下了酒宴要款待茅焦。
酒席上，赵太后对茅焦赞赏有加，她一迭声地称赞说：“先生是天下最正直的大臣。在危急时刻，先生转败为胜，安定秦国的江山社稷，使我们母子重新相会，这都是茅君的功劳啊！”后来，茅焦受到嬴政的尊敬，被立为太傅，尊为上卿。
茅焦富有胆略，他以秦国统一天下的目标说服了秦王，不但没有惹来杀身之祸，反而获得了重用。此时的嬴政虽刚刚亲政，但从善如流。他严厉惩罚乱党，褒奖进谏人士，一惩一奖，显示出年轻的嬴政已经具备处理政事的能力。
嫪毐被铲除了，赵太后的事情也处理妥当了。接下来该对付吕不韦了。吕不韦身为相国，有洛阳10万户的封邑，位高权重，在诸侯国中享有很高的声誉。他广纳贤才，有门客3000人，确实形成了一股不小的政治势力。秦王考虑到一场叛乱刚刚平息，如果随之诛杀声望很高的大臣，恐怕会引起更大的震荡，于是暂时不提治罪的事情。
秦王政十年，也就是公元前237年10月，嬴政终于免去了吕不韦的相邦职务。又把他遣出了京城，前往河南的封地。虽然他被免了职，可是到了洛阳仍不大老实，动不动以仲父自居。
洛阳城中的贵绅也有些知道他的底细，都瞧不起他。他为了扬名立威，招揽诸国来访的宾客，宾客越多，他就越施舍钱财；施舍的钱财越多，宾客也就越多。宾客多了，言谈之间，都是大话。
有个人向吕不韦献计道：“相国是秦王的仲父，如今免职，六国名人都为相国不平。依某之见，何不派说客到咸阳为相国游说、投简，向秦王表明相国无辜，使秦王回心，请相国再位列朝纲。”
吕不韦相信黄金和铜钱的力量是无与伦比的。他想：花钱收买众多的智谋之士为自己效力是很合算的。于是便点头答应了。
从此，到咸阳为吕不韦游说投简之客接马连鞍，几乎天天都有。大多说客到了咸阳，密买秦宫中的一些黄门，将简捅进去。秦王政得简后，知道这是吕不韦又在使心计，于是便采用了静观其变的政策。
廷尉李斯府中时常住有为吕不韦做说客的人，李斯对此置若罔闻。他打定主意不得罪人，既不说吕不韦做的不对，也不向秦王政奏说吕不韦宾客的活动情形。若有回洛阳的宾客，李斯便给吕不韦带些礼物或者寄封书信，只问“平安”二字，从不涉及秦王政和吕不韦之间的事。
此时关东诸国游客、间谍也到吕不韦那里凑热闹，到处宣扬：“秦国若不用吕不韦，六国都乐意接纳他。像他那么有才，当今没几个了！”
吕不韦当年遇子楚、献赵姬，成了大功是因为他有钱，免职以后，还想走此路。他想：“花点钱活动，总有一天秦王会下旨让我吕不韦再回咸阳为相。这样天下人都会把我当作先知和圣人来膜拜的！”
秦王听说后，恐怕他发动叛乱，就写信给吕不韦说：“你哪来的功劳，我秦国要封你那么多良田？你与我有什么血缘关系，我要叫你仲父？请你和你的家属迁到蜀地去吧。”
吕不韦看了这封简短的信之后，让他联想到自己已经逐渐被逼迫，害怕日后被杀，就喝下酖酒自杀而死。
这封绝情的信件，里面蕴藏着一些信息：嬴政否认了吕不韦的功绩，同样否认自己是吕不韦的儿子。这一点不难理解，吕不韦的功绩嬴政最清楚，嬴政这么做就是想告诉吕不韦：你别指望再回秦国了，还是离开为好。
而嬴政一方面透露出嬴政对自己的身世耿耿于怀，另一方面也表示出他要与吕不韦断绝所有关系，让吕不必再有慕秦的想法：我要你迁往蜀地，是放你一条生路。
通过这封信件可以看出，嬴政并不想杀吕不韦，只是要胁迫他离开是非之地，不得为六国出力。杀人的方法有很多种，对于性格暴戾而又大权在握的嬴政来说，杀死吕不韦并非难事。何必写这么一封决裂的信逼迫吕不韦去死。
嬴政写这封信时，似乎脑海里浮现出了一些往日的画面。吕不韦将自己的亲娘送给异人，而且是在亲娘怀着自己的时候，接着帮子楚得到王位，又辅佐自己建立基业。
吕不韦做错的是不该将亲娘送给异人吗？那么，怎么会有后来的自己。他做错的是与太后私通，又将嫪毐引入宫中。但嫪毐之事也是他始料未及的。这个可能是自己亲生父亲的人，就该惨死在自己的兵刃之下。
嬴政是恨吕不韦的，但是在这恨里面又似乎包含着一丝丝的爱意或敬意。吕不韦死了，是在看到嬴政的绝情信之后死去的。他不能存活于世，因为他恐惧嬴政的报复或是维护自己的尊严。
吕不韦看到了嬴政的残暴，害怕即使是亲生父亲，嬴政也不会放过他。吕不韦不愿在嬴政明令追杀之下赴死，那样的死没有尊严。然而，来自吕不韦内心深处最大的痛楚似乎不是这样。
嬴政是吕不韦呕心沥血辅佐的人，竟然给了他这样的一个结局，他以儿子相待的嬴政最后告诉他，他不认这个父亲，也不认他为秦国所付出的一切心力。
这样的一封信，将他们之间所有的一切化为灰烬。这样的打击恐怕比直接杀了他还具有杀伤力。吕不韦此刻的心情绝望、沮丧到了极点。生有何欢，死有何惧？纵有万贯家财，又有什么用。于是他选择了自杀。
吕不韦的一生充满戏剧性：曾经显贵无比，最终却以悲剧结束。头脑精明，善于经营，把子楚一步步地扶上王位，自己也获得了显赫的权势，拥有权力、财富和声誉，但却不能为自己的下半生周密安排。正如前人所批评的那样，他缺乏真诚。真诚虽然不能永远带来幸运，但虚假最终会遭遇不幸。
吕不韦的死，不光是因为他淫乱后宫使然。更重要的是，他在自觉与不自觉中僭越了君权。君王的权力怎么可以随便僭越。他掌管着君王的权力，却不懂得把握分寸。该放下权力的时候非但不放下，还加紧了在王权面前的炫耀。
《吕氏春秋》的编写完成使得嬴政进一步看到吕不韦的势力与功绩。他惧怕自己的地位受到威胁，铲除吕不韦的势力就成为压在嬴政心头的一块石头。
吕不韦这样长期越权，又不懂得低调，因此，最终被嬴政彻底铲除掉也是理所应当。这一点是政界精英时常犯的错误，抓住权柄不放，不甘寂寞在民间，最终落得身败名裂或晚节不保。
吕不韦的另一个错误其实算不上错误，确切地说还算是一项很好的治国方略。这就是他所主张的德政。秦国对投降的敌军多是进行灭绝人寰的屠杀，而吕不韦在任期间，对俘虏的敌军没有进行大规模的屠杀。最多一次杀戮也只是在攻占魏国时的“斩首三万”。
但后来性格暴戾的嬴政接手政权后，在统一六国的过程中依然奉行“法家”思想。这样下来，六国知道反正投降也是死，战也是死，不如死得光彩些，说不定战还能有一线生机。
吕不韦看到了这一点，便提出儒家的一些思想可以安国定邦。在《吕氏春秋》中吕不韦强调赢得民心要靠王道仁政，这是对商鞅变法以来法家思想的最大挑衅。
在法家思想灌输下的嬴政又怎会认同吕不韦的仁政思想呢？政见不同的君臣又怎么能长久相处呢？嬴政所担心的不过是赶走吕不韦后，没有人能接替吕不韦的位子，为秦国献计献策。
于是，嬴政开始寻觅能够胜任相国之职的助手。李斯就在这个时候出现了，李斯的出现让嬴政不再顾虑吕不韦离开后，秦国可能发生的动荡。剩下的就只是个借口而已。
这个借口已由嫪毐准备了。嫪毐这个被吕不韦送进秦宫，又被吕不韦带兵剿杀的人，最终还是让吕不韦自食恶果。在剿灭嫪毐之后，嬴政就开始对吕不韦下手了。
吕不韦死了，留下的是千秋功过任人评说。嬴政到底是不是自己的儿子，吕不韦到死也没有弄明白，嬴政反正是不认他这个父亲了，就算仲父也不想承认。吕不韦心如死灰，去与留此时已不再重要。
年仅23岁的秦始皇在短短的两年时间里，就先后清除了嫪毐、吕不韦两大势力集团，把大权紧紧掌握在自己手中。这为秦国吞并六国打下了坚实的政治基础。