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Immune Engineering
免疫工程

“百度魏则西事件”在一瞬间将免疫工程这一技术带到了风口浪尖。关于这项技术本身是否已经成了替罪羊的争论甚嚣尘上。但在下结论之前,人们十分有必要冷静地看看这一技术在美国的发展情况。免疫工程被《麻省理工科技评论》评为2016年10大突破技术之一。

撰文:安东尼奥·雷加拉多(Antonio Regalado)

突破技术

杀伤性T细胞可被用来消灭癌症。

重要意义

癌症、多发性硬化症和艾滋病毒(HIV)都可以通过免疫系统工程进行治疗。

主要研究者

-赛莱克蒂斯(Cellectis)

-朱诺治疗(Juno Therapeutics)

-诺华(Novartis)

在《社交网络》这部由大卫·芬奇执导、以Facebook创始人马克·扎克伯格为原型拍摄的电影中,有一位配角颇让人印象深刻,他就是好莱坞大帅哥贾斯汀· 汀布莱克扮演的肖恩·帕克。在电影中,他吸食毒品,并与维多利亚秘密女郎风流约会,而且为了利益他写了一张支票给爱德华多·萨维林,并朝其脸上扔去,然后把这位Facebook联合创始人赶出了公司大楼。

在现实中,肖恩·帕克这位很帅气的Napster创始人当然否认上述电影中的场景。但不可否认的是,他对技术发展趋势的判断向来十分准确,用慧眼如炬来形容他一点也不夸张,当年入股Facebook已经能够说明一二。最近,这位硅谷超级富豪的一项捐赠,将一项新兴的颠覆性技术带到了人们的视野中:癌症免疫疗法。

凭借总计1.25亿美元的捐款,帕克成立了以自己的名字命名的“帕克癌症免疫疗法研究所”。在组建团队上,他毫不吝啬,请来了加州大学旧金山分校的生物学家杰夫·布鲁斯通作为领头人。布鲁斯通在20世纪90年代的研究促成了其中一种癌症免疫疗法的诞生,是该领域非常著名的学者,拥有数十年的研究经验,发表了300多篇同行评审论文。

在运营策略上,帕克声称要将学术研究和医药行业进行连接。该研究所携手业内总计37家合作伙伴,几乎能找到的皆在其中。从传统医药巨头辉瑞,到热门初创企业朱诺治疗公司(Juno Terapeutics),再到非营利组织美国癌症研究协会。不开玩笑地说,帕克同学的策略是联合癌症免疫疗法行业中的几乎每个人。“帕克找了该领域的主要玩家,将最好的成员选出来,然后对他们说,我要给你钱让你玩到极致。”美国癌症协会首席医疗官奥提斯·布劳利如是说。他所在的机构是为数不多的没有与帕克研究所建立合作的组织之一。

如今难以用语言形容癌症免疫疗法是多么火爆。2014年以来,这一领域的数家初创公司陆续成功上市(如右上图表所示);2016年年初,约翰·霍普金斯医院成立了自己的免疫疗法研究中心,总投资1.25亿美元,其中包括来自亿万富翁、前纽约市长迈克尔·布隆伯格的资金;免疫疗法还是副总统拜登10亿美元抗癌“登月计划”中的重点板块;同时,很多医药公司也迫不及待地将更多免疫疗法纳入自己的产品线中。

繁荣时代

通过上市,免疫工程初创公司筹集了大量资金用于开展人体试验。

《连线》杂志甚至指出,在受欢迎程度上能与这项技术旗鼓相当的美国流行文化包括可颂甜甜圈、菲比小精灵以及2005年后的Facebook。如此火爆,那么免疫工程究竟是什么呢?

免疫工程:已知的“杀手”

人类免疫系统被称为大自然的“大规模杀伤性武器”。它拥有十余种主要细胞类型,其中包括多种T细胞。它会抵御从未见过的病毒,比如抑制癌症(尽管并非总是如此),而最主要的功能是避免伤及自己的身体组织。它甚至还有记忆功能,而这也是疫苗接种的依据。

100多年前,美国外科医生威廉·科莱注意到,有时候意外感染会让肿瘤消失。随后,科莱将链球菌培养基注入到癌症患者体内,发现在部分病例中出现了肿瘤收缩的情况。1893年发表的这一发现表明,免疫系统是可以对抗癌症的。但当时因为太多问题无法回答,癌症免疫疗法仍只是被当作一个失败的理念。

然而,经过40多年的科学研究,研究者们终于开始了解肿瘤细胞和免疫系统对话的本质,并逐步绘制出了控制免疫系统与肿瘤互动方式的分子网络。在过去的几年里,基于这些洞见,医药公司和实验室开始研究修复免疫系统的行为。

在所有的提议中,最极端的方法是改变T细胞内的基因指令。目前,通过TALENs或最新的CRISPR等基因编辑技术可以轻松做到。2015年,基因编辑初创公司爱迪塔斯医药(Editas Medicine)和英特利亚治疗(Intellia Terapeutics)均与研发T细胞疗法的公司签署了合作协议。“这是一个完美的开始。”加利福尼亚大学旧金山分校研究人员杰弗里·布鲁斯通说,“免疫细胞是运转良好的机器,但我们可以让这种运转更加顺畅。”

基于过去几十年的研究工作(以及与免疫学相关的诺贝尔奖成果),研究人员已经发现了很多重要细节,包括T细胞如何识别和杀灭入侵者等。透过显微镜,我们可以看到这些细胞会展现出类似于动物的行为:爬行,探查,然后抓住另一个细胞,向其注入中毒性颗粒。就像小机器人一样,T细胞具有四处移动的能力,能够同其他细胞对话,会释放毒物,可改变微环境,具有记忆功能,并可实现自我增殖。

2015年,研究者们制造了一些未来派的新型T细胞。在注入特定药物的情况下,这些细胞才会发起靶向搜寻和杀灭行动。也就是说,这一特征可以让这些细胞在特定的时间和地点发起进攻,具备被“遥控”功能。目前,这些细胞只在小鼠身上进行过测试。

免疫工程时间线

5亿年前

颌鱼最先进化出“适应性”免疫力——通过特化细胞了解、记忆和应对威胁。

1796年

爱德华·詹纳将牛痘脓胞中的物质注射到一名男童体内,以预防更为致命的天花病毒。这被认为是我们人类的第一种疫苗。

1893年

纽约外科医生威廉·科莱认为癌症可以通过免疫反应治愈。他利用活细菌即所谓的“科莱毒素”治疗肿瘤。

1908年

德国医生保罗·埃尔利希以其提出的免疫系统理论而获得诺贝尔奖。他引入了“仙药”理念,亦称“魔弹”,可以说是当今靶向药物的前身。

1971年

美国总统理查德·尼克松宣布发起“抗癌战争”。美国国家癌症研究所的预算随之升至3.78亿美元,按当前币值计算约为21亿美元。现在,该研究所的预算为49.5亿美元。

1981年

HIV大流行拉开序幕。1987年,首个抗逆转病毒药物——叠氮胸苷(AZT)上市销售。时至今日,HIV疫苗仍在研发中。

1983—1987年

科学家发现了T细胞抗原受体。杀伤性T细胞通过这种抗原受体区分病毒感染细胞和癌细胞。

2000年

法国治愈了两名免疫缺陷儿童。这也是基因疗法在治疗“气泡男孩”病中的首次成功运用。医生将一种缺失的基因植入到他们的骨髓中。

2011年

首个免疫检查点抑制剂——易普利姆玛(ipilimumab)在美国获批用于治疗晚期黑色素瘤。该药物会释放T细胞。在很多患者身上,治疗效果显著。2011 美国宾夕法尼亚大学的卡尔·朱恩宣布通过基因改造的T细胞攻克白血病。

2015年

美国前总统、90岁的吉米·卡特接受免疫疗法治疗黑色素瘤和脑癌。后期脑部扫描显示肿瘤消失。

2016年

鉴于免疫疗法的“神奇进展”,美国总统贝拉克·奥巴马和副总统约瑟夫·拜登宣布启动攻克癌症的新的“登月计划”。

另外一种新型T细胞被研究者们称为“谷歌高级搜索”,即只有在某种癌细胞被锁定两种不同的标记后,它才会发起攻击行动——相当于对敌对细胞进行双重确认。这些工作都至关重要,因为将T细胞靶向到肝、肺或脑的肿瘤是非常危险的。有些患者在试验阶段会因为T细胞的误杀而不幸身亡。

抢滩布局

赛莱克蒂斯(Cellectis)是一家成立于法国的生物技术公司,总部现位于美国纽约曼哈顿东区,它的首个T细胞疗法在2015年年底被制药公司辉瑞(Pfzer)和施维雅(Servier)收购。该公司发明了一种名为TALENs的基因编辑方法,即通过活细胞中的DNA剪切和修复,进行癌症治疗。赛莱克蒂斯是从2011年开始研发这种疗法的。

赛莱克蒂斯开发的T细胞有着很广泛的应用。先前的疗法使用的是患者自己的细胞,但有的患者体内并没有足够的T细胞。有先见之明的赛莱克蒂斯决定利用基因编辑技术开发高度工程化细胞,最终的目的却很简单,即实现T细胞的“普遍”供应。但T细胞一般具有巨大的杀伤潜力,并不那么容易供应。因为问题在于,你不能将X先生的T细胞注入Y先生体内,否则这些细胞会把Y先生视为“非自我”,并发起全力攻击。这样一来,患者就会陷入危险境地。

但如果T细胞经过了基因编辑技术处理,这种风险基本可以消除,而这也是所有人所希望的。目前,这项技术已经在超过300名患者身上进行了测试,效果显著。10余家制药公司和生物技术公司正致力于将这种疗法推向市场。

另外值得关注的是,朱诺治疗在2016年1月以1.25亿美元的价格收购了专注于单T细胞DNA测序的波士顿公司AbVitro。现在,该公司正试图确定癌细胞中的活跃T细胞,并对其受体展开研究。朱诺治疗首席科学家海厄姆·列维茨基表示,原先需要7个月才能完成的实验现在只需要7天,而数据累积也越来越多,平均一次实验可产生100GB的信息。“很多事情都是技术驱动的。”他说,“这些问题的出现已经有一段时间了,但无法找到答案。现在通过新技术,我们可以以前所未有的方式审视它们。”

重大交易

T细胞公司纷纷与制药公司和基因编辑专家签署合作协议。

2012年8月

瑞士制药巨头诺华与美国宾夕法尼亚大学达成一项全面合作协议,而后者是工程化T细胞的早期实验成功者。

2015年1月

诺华收购英特利亚治疗公司的CRISPR基因编辑疗法。朱诺治疗和爱迪塔斯医药后来也以2 500万美元的价格达成了一项类似协议。

2015年6月

生物技术公司新基(Celgene)向总部位于西雅图的朱诺治疗支付10亿美元,用于T细胞疗法的合作开发。

2015年11月

制药公司辉瑞和施维雅以4 000万美元的价格收购赛莱克蒂斯首个“上架的”白血病T细胞疗法。

2016年1月

食品制造商雀巢(Nestlé)向初创公司赛雷斯(Seres)支付1.2亿美元,用于研发可防止感染和免疫紊乱的细菌类药品。

2016年1月

朱诺治疗以1.25亿美元的价格收购波士顿公司AbVitro;AbVitro可对单T细胞内的DNA进行排序。

2016年3月,由百特国际(Baxter International)分拆出来的新制药公司Baxalta宣布,总计投资超过17 亿美元,将与基因编辑公司Precision Bio Sciences进行合作,专攻新兴的免疫治疗市场。2016年1月,总部设在都柏林的制药公司Shire医疗宣布将以320亿美元的高价收购Baxalta公司,意在打造世界最大的罕见病制药公司。Baxalta雄心勃勃地表示将开发6种不同的免疫治疗药物,并预计首款药物将在明年进行临床试验。

为了应对来自同行日趋激烈的竞争,帕克研究所的策略是联合加州大学旧金山分校、加州大学洛杉矶分校、宾州大学、斯坦福大学、 MD安德森癌症中心和纪念斯隆-凯特琳癌症中心六家著名机构——这些机构的研究人员将一道全力研究三大问题:改造T细胞抗癌,寻找癌细胞的“开关”,以及发现会让癌细胞逃避免疫系统的检查点抑制剂。

不仅在研发方面,“帕克联盟”在临床试验方面的合作也十分紧密。试想,如果一家医药公司要测试一种罕见癌症的抗癌药物,在单一地点可能需要花费两年的时间才能招募到足够多的病人;但在帕克研究所里,他们可以接触到六个地点的病人,而只需同一组人员来处理就行了。无疑,医药公司会喜欢这种方法,因为省去了他们几个月的时间,不用来来回回争论。

甚至,“帕克联盟”的研究专利也是由一组律师解决。帕克研究所将尝试一种新的模式,即与研究人员所属的中心和大学共享一部分专利。这就意味着,如果这些专利日后成了畅销药,那么部分钱会用来继续资助研究所的研究工作。而且,新模式也解决了专利导致的研究问题:通常来说,免疫疗法结合使用更好,但是很难让不同的公司都签同一个试验;这家公司有这个,那家公司有那个,两者永不聚。但如果帕克研究所拥有了全部相关免疫疗法的专利,之后和医药公司签署许可协议,问题就迎刃而解了。

然而现如今,参与免疫疗法研究的硅谷科技企业也绝不止帕克一家。2015年,谷歌在麻省理工学院举办了两场有顶级免疫肿瘤学家和生物工程师参加的峰会,旨在确定免疫疗法的哪些部分可以“谷歌化”。与会人员表示,这家搜索巨头对迅速发展的新的肿瘤活检技术的研究非常关注。这些技术方法很可能将产生关于免疫系统细胞的大数据,比如T细胞在肿瘤内的具体活动,以及T细胞如何对肿瘤产生影响等。但到目前为止,谷歌的生命科学部门Verily还没有正式公布其在癌症免疫疗法方面的计划。

除了创业公司、科技巨头、癌症研究院和大型制药公司,医院也是积极参与方。著名的纽约西奈山医院从今年开始也将开始从事临床试验。患者会被注入一剂异常蛋白片段,而这些片段会训练T细胞攻击癌细胞。

Facebook前雇员、现担任西奈山医院及医学院下属实验室负责人的杰弗里·哈默巴赫尔对《麻省理论科技评论》(MIT Technology Review,简称 MIT TR)表示,他正在与12名程序员一道研究T细胞,开发可解释患者癌细胞中DNA序列以及可从中预测杀伤性T细胞反应的软件。“有趣的是,我们向美国食品药品管理局(FDA)提交的并不是分子而是算法。”他说,“这或许是最早将程序输出作为疗法的案例之一。”

挽救癌症患者的生命,但只是一个开始

2015年6月,12个月大的英国女孩蕾拉·理查德兹(Layla Richards)已经处于病危状态。她是一名白血病患者,虽然接受过很多次化疗以及一次骨髓移植,但癌细胞仍在不断扩散。

女孩所在的伦敦大奥蒙德街医院的一名医生给上面提到的赛莱克蒂斯公司打了电话。“我们接到了一个电话。医生说,‘我们收治了一名缺乏T细胞的小女孩,现在已经无计可施’。”赛莱克蒂斯首席执行官安德烈·舒利卡说,“他们希望获得一瓶还在质量控制测试阶段制造的T细胞。”

医生希望将蕾拉作为一个“特例”,即通过未经临床试验的药物进行治疗。这是一场赌注,因为这种疗法仅在小鼠身上试验过。如果治疗失败,赛莱克蒂斯的股价和声誉将会大跌,而即便取得成功,该公司也可能会遭到监管机构的调查。“一边是对生命的挽救,一边是对坏消息的规避。”舒利卡说。

2015年11月,大奥蒙德街医院宣称蕾拉的病已经治愈。英国媒体竞相报道这则感人的故事,对这名勇敢的女童和敢于作为的医生大加赞赏。铺天盖地的头版报道让赛莱克蒂斯的股价大幅飙升。两个星期后,制药公司辉瑞和施维雅宣布它们将以4 000万美元的价格收购这一疗法。

虽然蕾拉案例的很多细节至今没有披露,一些癌症专家也表示工程化T细胞在其治疗中所发挥的作用仍不明朗,但她的康复无疑给很多人带来了希望。只是所有人都明白这只是个开始,并非意味着我们已经能够挽救癌症患者的生命。

超越癌症

在“免疫工程”以及免疫系统的控制和操作上的进步,将会给癌症治疗带来意想不到的突破。此外,这些进步还会催生用于治疗HIV和自身免疫疾病,如关节炎和多发性硬化症等。

2015年3月,辉瑞任命林家扬担任该公司旧金山生物技术部门的负责人。该部门负责癌症药物的开发,最近又开始制造工程化T细胞。林家扬表示,他的公司早在媒体报道蕾拉事件之前就已同赛莱克蒂斯展开磋商,当时甚至都没有人料到她会被治愈。“这是一个巨大的惊喜。”他说。

林家扬表示,多年的科学研究工作最终结出果实,使得治疗产品成为一种可能。他认为,这种疗法将不仅仅局限于白血病,也不仅仅局限于癌症。“我们认为这个基本原理,即改造人体细胞,会有更广泛的寓意。”他说,“而免疫系统将会成为最便捷的工具,因为这些细胞可以移动和转移,并会发挥重要作用。”

研究人员早已对自身免疫紊乱展开研究,比如糖尿病、多发性硬化症和狼疮等。传染病也已进入T细胞工程师的视野。美国国家卫生研究院病毒学家、揭示HIV感染人体细胞机制的爱德华·贝格尔认为,对病毒进行永久阻断是可能的,即所谓的“功能性治愈”。2016年2月,他表示,将会把基因改造的T细胞注入猴子体内,寻找并摧毁任何存在的免疫缺陷病毒的细胞。

真正的流程并不像理论这么简单。贝格尔认为,未来的路还很长,而且充满曲折。此外,大多数涉及工程化T细胞的规程都需要患者或猴子服用可临时杀灭自身T细胞的药物,而在此过程中,风险不可避免。但从目前的技术发展来看,这是一种非常激进的治疗方法。尽管在治疗HIV方面已经取得进展,但方法还有待改进。即便是在治疗之后,病毒也会隐藏在人的体内,所以患者需要终生服用抗逆转录病毒药物。而通过免疫工程技术,则可能不需要。这让研究者们看到了一次治疗就可永久阻断病毒的可能性。

“癌症研究工作让我深受鼓舞。”贝格尔说,“我们可以借鉴白血病的治疗理念。通过免疫系统工程治疗其他疾病将是未来的一个主攻方向。就传染病而言,我认为HIV是一个最佳实验对象。如果你同HIV群体交谈,你会发现他们急需一种疗法,一种可以一劳永逸的疗法。”

专家点评

田埂

博士,毕业于中国科学院研究生院,元码基因联合创始人,曾任清华大学基因组与合成生物学中心主管,华大基因华北区第一负责人,天津华大创始人、总经理,深圳华大基因研究院研发副主管。参与多项863、973项目。以通信作者和第一作者发表文章10余篇,拥有发明专利10余项

当一项科学技术有希望治愈人类最难医治的癌症时,那么无论从重要性还是商业方面它都拥有了足够的噱头。免疫工程正是这个时代科学与商业碰撞下的产物。从技术本身来讲,它的原理并不复杂,但想要完全实现它治疗肿瘤的目的,还需要很多其他技术的辅助支持。这也正好比是一项庞大的工程,有了一份壮丽的蓝图,但仍需要一砖一瓦的积累完成。

免疫治疗最大的好处就是,它来源于自身,对自身的无害性。这种无害性是生物适应了百万年进化而来的。在很多癌症基础研究还未明的情况下,有些蛋白的功能还未确定,如PIK3CA,这个在癌症中突变频率几乎仅次于TP53的蛋白,正在经历一场到底是癌基因还是抑癌基因的讨论。如果免疫工程的进步不能足够扎实的话,可能会导致一些新的问题甚至完全相反的结果发生。无论如何,正如我们前面提到的,免疫工程这份蓝图本身非常壮丽,它为人类最终战胜癌症提出了一个完美的设想,但我们希望它不要因为太多的商业干预而影响了自己的发展节奏。 B0chzixVKts39TNKzLzrq5jd7qfO2F/IByUXuWjgg2KOutvtkKOLAeCyyTWMPUm7

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