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本书坚持以马列主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想和科学发展观为指导，同时注意借鉴和吸收西方经济学的合理内核和方法，将逻辑分析方法、系统分析方法、多学科集成分析方法等有机结合起来，探索符合中国国情的具体方法和路径。
本书研究的循环经济是建立在世界经济发展史和科技发展史纵向梳理基础上的，是基于对世界经济、资源、环境三者之间变动的内部规律的逻辑分析而得到的建立在循环经济理论和产业集成理论基础之上的产业组织模式创新。对循环产业集成的研究过程是按照先理论后实践、先静态后动态的方法进行的，复合一般的逻辑思维模式。所以，本书的研究具有浓郁的逻辑分析色彩。
循环产业集成本来就是一个多术语的结合体，其理论基础非常广泛。循环产业集成既包含循环经济理论又包括产业组织理论、集成理论、中间性组织理论、复杂系统论等。本书将静态研究和动态研究相结合，从耗散结构理论和协同学的视角出发来研究和分析循环产业集成的内涵、实质、特点、形成路径以及采取的具体步骤，探索循环产业集成系统的实现条件，为在现实中构建高效有序的循环产业集成奠定理论基础。
对循环产业集成模式的研究是一个定性与定量分析相结合的产物。通过定性分析，把循环产业集成的性质、特征、类型等方面进行归纳、总结和刻画，明确了对循环产业集成的把握；通过定量分析，将循环产业集成各部分、各阶段的运动发展进行了具体的量化，从而探明了问题的研究路径和实施方法。在对循环产业集成概念、框架、原则等问题进行研究时，作者使用了定性分析；在对循环产业集成步骤、演进路径等问题进行分析时，作者应用了定量分析。将定性分析与定量分析相结合，既有利于从宏观上把握循环产业集成的本质，又有利于从微观上解决循环产业集成在发展过程中存在的具体问题。
循环产业集成与其他产业组织模式最大的不同在于它始终坚持系统分析原则，将产业组织纳入到经济发展当中，将产业系统纳入到自然生态系统当中，从环境资源可承载的资源消耗与废物排放来倒推产业组织模式，并得到循环产业集成。而且，对循环产业集成的研究也不是一个静态的理论构建，而是培育一个充满活力的包括理论基础、实现条件、制度保障以及实践对象的完整有机体。本书从系统复杂理论出发，运用多学科研究方法，建立了一个循环产业集成系统框架，揭示了在多因素共同作用下，循环产业集成系统的协同旋进、合作创新、自组织与他组织的演进过程。