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第二道清除机制，是在肺泡里“打扫卫生”的巨噬细胞，它们把肺泡里的垃圾清理以后，垃圾被“小刷子”纤毛又刷到人的喉部，通过咳嗽排出体外。
打喷嚏、咳嗽、排痰：“清扫”有害物
肺具备一定的自洁能力，“清扫”有害物一是靠呼出，比如打喷嚏，鼻子有纤毛，一些异常物质如果进到鼻子里，会通过喷嚏打出来；还有一个就是咳嗽，能排出呼吸道内的异物或分泌物；再就是排痰，通过肺脏的分泌物，将有害物质包裹住（如吸入的粉尘），排出体外。如果我们一天都在外面参加聚会集会，第二天痰是灰色的，这是健康的运载功能，说明把有害的东西排出来了。
肺内的巨噬细胞能杀灭病菌
空气中有很多粉尘、漂浮物以及PM2.5等可吸入颗粒物，PM2.5会直接进入肺泡细胞并永远留在那里，进而引起肺部病变，而其他大于10微米的可吸入颗粒物，被吸入体内后不会主动进入肺泡，可能会被人体以咳痰等方式排出去，然而排不出去的有害细菌、微生物也会被肺泡里的巨噬细胞（属于一种大吞噬细胞，也是一种免疫细胞）吞噬，进入肺泡和细胞内部。
