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公元490年，冯太后死，孝文帝亲政，继续进行改革。公元494年（太和十八年），把都城由平城迁到洛阳，改变了过去对中原遥控的形势，有利于统治整个国家；也解脱了一百多年来在平城形成的鲜卑贵族保守势力的羁绊和干扰，有利于继续进行改革。迁都本身虽不属于制度的改革，但却是孝文帝改革的总体工作中的一个重要环节。
北魏都城平城所处位置偏北，周围农业不太发达。为了解决粮食问题，加强对南部区域的控制，更好地吸收汉族文化，孝文帝就决定把都城迁到位置适中、经济文化发达的洛阳。鲜卑贵族大多反对迁都。孝文帝没有退却，他巧妙而坚定地施行迁都计划。公元494年，孝文帝率军南下攻打齐朝，鲜卑贵族随军从平城来到洛阳。休息几天后，孝文帝命令继续南进。贵族们不适应南方的气候和水土，更怕死在战场上，于是，跪在马前，哀求孝文帝放弃南下计划。孝文帝做出很生气的样子，一再指责贵族们阻碍他完成统一江南的大事业，放弃南下也就算了，但必须迁都洛阳；否则兴师动众，一件事都没有办成，天下的人岂不笑话我？贵族们没有别的选择，只好同意。后来，孝文帝又处死了进行还都平城阴谋活动的太子拓跋恂。从那以后，贵族们再也不敢提迁回平城的事了。
北魏迁洛以后，平城的政治地位下降，城市发展停滞不前，到了孝昌二年（公元526年），北魏六镇地区的人民发动了大规模的反魏斗争，起义军攻入平城，城市遂陷残破。此后的各代，大同分别做过恒州、云州等州的州治。大同这一名称的出现迟至辽代。辽重熙七年（公元1038年）分云中县的一部分建置大同县，此后至今的近千年，大同这一名称一直没有改变。