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新疆，古称西域，自古以来就是中国领土不可分割的一部分。公元前60年，西汉中央政权设立西域都护府，总管西域事务。1884年，清政府在新疆设省。1949年新疆和平解放，1955年10月1日成立新疆维吾尔自治区。在漫长的岁月中，新疆经历了多次的行政区域变革。
西汉时，新疆称为西域。作为一个地理概念，西域有广义和狭义之分。广义上的西域指敦煌以西的天山南北地区及帕米尔高原以西的广大中亚地区，甚至包括更远的地方；狭义上的西域则指玉门关和阳关以西至葱岭的地区，即指今新疆的广大地区。
公元前138年，汉武帝派张骞出使西域，意欲联合月氏共抗匈奴，但未能如愿。公元前121年，汉军攻取河西走廊地区，设置了武威、张掖、酒泉和敦煌四郡，并在凉州刺史部西端的敦煌郡设置玉门关和阳关，史称“列四郡，据两关”，使汉朝的管辖地直接与西域相连。公元前119年，张骞再次出使西域。其后汉军大将李广利两次伐大宛，极大地震动了西域各国，使得各国纷纷遣使修好。公元前60年，匈奴逐日王率众归附汉朝，次年汉于乌垒城设西域都护府，管辖天山以南葱岭以东三十六国。公元前48年，汉元帝置戊己校尉，辖境扩至天山以北乌孙和葱岭以西大宛，共辖西域四十八国。汉哀帝、汉平帝时期所管辖西域之国增至五十国。自此，新疆大部地区正式纳入汉朝版图。
东汉建立后，西域各国请求东汉政府派遣西域都护。三国时魏统领西域长史府，由于各国之间相互征伐兼并，逐渐形成了焉耆、龟兹、莎车、车师、于阗、鄯善等几个大国。南北朝时期，柔然兴起于蒙古高原，西域一度为柔然控制。公元6世纪中叶，突厥兴起，建立起地域广阔的突厥汗国，除东南部归吐谷浑外，新疆大部归突厥汗国管辖。
隋朝政府实施“远交而近攻，离强而合弱”的政策，对突厥实行分化。603年，突厥分裂为东、西两个汗国。
630年，唐灭亡东突厥汗国，后在西域建立起郡县统治。640年，唐灭麹氏高昌，拉开了统一西域的序幕，后在交河设安西都护府。648年，唐取得征伐西突厥的重大胜利，焉耆、龟兹、于阗等国归降唐。658年，唐平定阿史那贺鲁叛乱后，西突厥全部归唐。此后中亚诸小国纷纷归附唐朝，唐版图扩展至葱岭以西。安史之乱后，吐蕃取代唐成为西域的管理者。840年，大批回鹘部众迁至西域，并建立政权，史称高昌回鹘王国。几经争夺后，回鹘取代吐蕃成为西域的统治者。
10世纪初，契丹建辽于漠北。辽灭亡前夕，皇族耶律大石率众西迁，建立了西辽王朝，后高昌回鹘王国归附西辽。
13世纪初，蒙古统一了西域。1251年，设别十八里行尚书省于天山北部，这是内地行省制度第一次在西域实施。随着元朝的日益衰落，西域大部都处于东察合台汗国的统治之下。
1514年，察合台后裔在叶尔羌建立政权，史称叶尔羌汗国，天山南北归其统辖。1680年，叶尔羌汗国被准噶尔汗国所灭。
清朝建立后，准噶尔蒙古即向清遣使示好，后噶尔丹为首领后，不断骚扰已归附清朝的喀尔喀蒙古、哈密和青海等地。从此，清朝与准噶尔部进行了长达百余年的争战。1755年，清朝攻灭准噶尔汗国，取得新疆天山以北地区管辖权。1757年，大小和卓在南疆发动叛乱，经过多次较量，清军于1759年平定，天山南北统一于清朝。1762年，清朝设伊犁将军府，总领天山南北军政事务。
高昌故城
高昌故城遗址坐落在吐鲁番市东约40千米的哈拉和卓乡所在地附近，北距火焰山南麓的木头沟沟口（胜金口）约6.5千米，东距鄯善县城约55千米。1961年3月，被国务院首批公布为全国重点文物保护单位。
鸦片战争后，沙皇俄国利用其地缘优势，在吞并中亚地区之后，加紧了对我国新疆的侵略。1851年，《中俄伊塔通商章程》签订，沙俄获取了单方面设立领事和在新疆贸易免税的特权。1864年，《中俄勘分西北界约记》签订，沙俄吞并了我国西北边疆44万平方千米的领土。1871年，沙俄侵占了我国伊犁地区。1875年，左宗棠指挥清军收复新疆，用时一年半收复南疆，收复伊犁也提上日程。1881年，《中俄伊犁条约》签订，次年，伊犁正式回归祖国怀抱。至此，新疆重回清朝管理之下。
收回新疆后，为了加强统治，清政府于1884年设立新疆省。此后，内地与新疆的经济与文化联系日益紧密。
1912年，中华民国成立。中央临时政府改新疆巡抚为都督。
1949年12月17日，经中央人民政府批准，成立了新疆人民政府。新中国成立后，平等、团结、互助的新型民族关系建立起来，按照《中国人民政治协商会议共同纲领》的规定，在新疆实行民族区域自治制度。1955年10月1日，新疆维吾尔自治区成立。从此，新疆走上了繁荣昌盛的道路。
伊犁将军府大院
伊犁将军为清朝新疆地区最高官职，伊犁将军统辖新疆南北两路（天山以北的准噶尔蒙古故地为“准部”，天山以南的叶尔羌国故地为“回部”），包括巴尔喀什湖以东、以南，额尔齐斯河上游，天山南北两路，以及楚河、塔拉斯河一带和帕米尔等地的军政事务。
美丽的乌鲁木齐
乌鲁木齐是新疆维吾尔自治区的政治、经济、文化、交通、科技、信息中心，是我国西北地区重要的中心城市，还是沟通新疆南北和连接我国内地与中西亚及欧洲的交通和通信枢纽。