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全书选取了一百二十多种常见的植物药材，图鉴按照《本草纲目》的分类方法，标明了各种药材在书中的页码，同样也注明了其按功效分类的所属。
草部·山草类
防风
细辛
柴胡
升麻
玄参
知母
白鲜
黄芩
黄连
白头翁
紫草
独活
秦艽
苍术
远志
延胡索
丹参
地榆
白前
贝母
桔梗
人参
前胡
甘草
淫羊藿
肉苁蓉
黄芪
巴戟天
沙参
玉竹
黄精
草部·芳草类
荆芥
香薷
薄荷
马兰
豆蔻
茉莉
兰草
莎草
川芎
姜黄
当归
芍药
肉豆蔻
草部·隰草类
麻黄
苍耳
菊花
牛蒡
夏枯草
决明子
鸭跖草
连翘
酸浆
紫花地丁
半边莲
青蒿
车前草
瞿麦
灯芯草
大蓟小蓟
艾
益母草
王不留行
红花
旋覆花
款冬花
地黄
麦门冬
草部·毒草类、蔓草类
泽漆
附子
甘遂
芫花
半夏
天南星
葛
天花粉
大黄
牵牛子
马兜铃
菟丝子
五味子
草部·水草类、石草类、苔类
泽泻
香蒲
酢浆草
石斛
骨碎补
菜部·荤辛类、柔滑类、蓏菜类、水菜类、芝栭类
葱
胡荽
干姜
茴香
蒲公英
苜蓿
韭
冬瓜
灵芝
果部·五果类、山果类、夷果类、味果类、蓏类、水果类
桃
枣
梅
木瓜
石榴
龙眼
槟榔
山楂
花椒
吴茱萸
胡椒
莲藕
木部·香木类、乔木类、灌木类
桂
丁香
苏合香
杜仲
松子
金樱子
桑
枳
郁李
枸杞
槐花
檀香
