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有些疾病也会形成口腔内高酸性的环境，特别是胃食管反流。胃食管反流是多种原因形成的胃肠动力障碍疾病，常见症状有恶心、反酸、食管狭窄、声音嘶哑等。胃食管反流是现在的人们常见的肠胃疾病，主要原因有两大类：饮食习惯与心理压力。其中，饮食习惯包含咀嚼习惯和食物内容。咀嚼习惯是指食物没有细嚼慢咽，进到胃肠之后，增加了对胃的破坏。菜梗或咬不碎的食物无法通过咀嚼成为像汤汁一样的食糜，这些较硬的食物会刮伤胃壁，对胃造成破坏。食物内容是指过度加工制品和慢性过敏原，过度加工制品有素鸡、素肉、火腿、香肠等，慢性过敏原如常见的奶、蛋、面粉等，都是容易造成胃肠不适和炎症等症状的食物。
胃食管反流患者就算睡前很认真地清洁牙齿，睡觉时逆流的胃酸还是会侵蚀口内牙齿的珐琅质，进而导致蛀牙。所以，这类患者要改善牙齿疾病前，应先至肠胃科针对胃食管反流的问题治疗，甚至到心理科评估压力指数，或是请专业医生评估自主神经系统的问题（一般三甲综合医院都配有肠胃科和心理科）。通过减轻压力以及养成正确的饮食习惯改善肠胃问题，最后减少口腔酸性环境的出现，才能将牙齿的受破坏程度降到最低。
人体消化系统
人类经过几十万年演化，在正常咀嚼之后，唾液会对食物进行初步消化再进入胃，经过胃的蠕动和胃酸协助杀菌之后才进到小肠，小肠还需要免疫系统、胆汁和人体最大的排毒系统肝脏一起参与消化过程——这意味着，即使食物细嚼慢咽进入肠胃后，食物中仍然存在大量的细菌，需要一点点杀菌处理。如果吞咽的时候习惯囫囵吞枣，进入胃肠的细菌就更多了。
食物在口中咀嚼，除了咬碎磨细以利胃部消化外，更重要的是在细嚼慢咽的过程中，唾液腺会分泌足够的唾液，唾液中的酶会帮助食物消化，减轻胃部负担。所以当咀嚼不完全时，唾液分泌不足，便容易引起肠胃不适或疾病。唾液除了有助于消化食物、协助吞咽，还可以清洁牙齿、舌头及黏膜上的污垢，有抗菌、杀菌的作用，能保持口腔清洁，保护牙齿和黏膜。所以，细嚼慢咽是保护牙齿的根本，不仅可保护牙齿，也能降低肠胃负担，减少肠胃不适与胃食管反流的症状，从而促进副交感神经兴奋（副交感神经能帮助人体放松），让身体自然而然减轻压力。相对的，囫囵吞枣会导致交感神经兴奋（交感神经会导致人体紧张），让肠胃静止下来减少工作，使得消化吸收变差，就算吃再多的肠胃药也没有办法改善肠胃问题。
胃食管反流的原因及症状
古时候不像现代这么科学，可以抽血或靠特殊仪器来检测过敏原，古人会在清早起床时通过口中的气味来分辨过敏食物（起床后的唾液跟前一个晚上吃过的食物有关），若食物无法消化甚至引起胃食管反流，口中产生特殊气味，就表示前一个晚上吃的食物对身体可能是有害的。虽然现在已有检测出过敏原及过敏程度的技术，不过仍无法全面检测出过敏原，因为撇开环境不谈，光食物中的过敏原就数不清了，所以只能就大部分人们常吃的食物检测。检测后可以发现，每个人对食物的代谢能力都不一样，无法得到客观的比较，不过若是全家人一起检测，就能比较容易比对出过敏原为何物了。因为一家人吃的通常会差不多，若过于频繁地吃某种食物，出现了过敏值偏高的现象，那就减少吃该食物；若不常吃的食物，过敏数值仍偏高，就表示身体对该食物的代谢能力较差，也要减少摄取该食物。此外，喜欢吃某样食物便常常吃，这是许多人的通病，若是希望身体不会出现过量反应，应采取交替的方式食用。不容易出现过敏现象的食物，建议四五天吃一次。过敏反应越大者，间隔时间就要越久，譬如隔两三周再吃一次。
这里我列举出统计上多数人较容易过敏的食物给大家参考，但实际上每个人真正会产生过敏的食物还是得经过检测才能确认。谨慎食用含过敏原的食物，可降低肠胃负担，防止胃食管反流，减少蛀牙发生的机会。
| ○ 牛奶 | ○ 酵母 |
| ○ 蛋白 | ○ 花豆 |
| ○ 蛋黄 | ○ 小麦 |
| ○ 奶酪 | ○ 甲壳类海产 |
| ○ 花生 | ○ 海带 |