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奥杜韦文化之后是阿舍利文化，它以三面体的工具为特征，主要工具是手斧。按照考古学的划分方法，在旧石器时代与新石器时代之间通常还有一个中石器时代。古埃及是如何从旧石器时代过渡到新石器时代的，目前我们的了解还不清楚。大约在公元前7000—前4500年，埃及的历史进入了新石器时代。新石器时代在埃及大约经历了2000年的时间，与漫长的旧石器时代相比，不足其1/3的时间。时间虽短，但是它在埃及文明的演进过程中却具有十分重要的意义。正是在这个时代，古代埃及人从狩猎、采集，发展到畜牧、农耕阶段，由猎人、采集者演变成为牧民和农民。埃及似乎没有纯粹的新石器时代文化，因为新石器文化总是与铜石并用时代的文化紧紧结合在一起。因此，埃及的新石器时代与铜石并用时代并不能严格区别开来。
埃及的新石器时代的文化与铜石并用时代文化以上埃及的塔萨·巴达里（Tasian-Badarian）文化、涅伽达文化（Naqada）I、涅伽达文化II、涅伽达文化III为典型，通常把它们称为前王朝文化。前王朝文化是埃及人从野蛮时代向文明时代的过渡，也是古埃及文明的开端。
关于塔萨文化的性质问题尚难以确定，有人认为塔萨文化比巴达里文化还要古老，而巴达里文化只是塔萨文化的进一步发展而已。但是，也有人主张把塔萨文化归并于巴达里文化。无论怎样，塔萨文化至今还没有发现铜器，而巴达里文化则是铜石并用。巴达里文化的基本生产工具是石器，最普遍的工具形式是两面具有锯齿形边缘的石质镰刀。巴达里文化的陶器可以分粗制陶和精制陶两类。粗制陶形状简朴，制作粗糙。精制陶制作精致，主要有红光陶、黑光陶和黑顶陶。黑顶陶以带有黑顶为特征，它不仅在前王朝时期晚期广为流行，而且一直流行到后来的王朝时期。
巴达里的居民已经是“食物的生产者”，他们经营农业、畜牧业和渔业。种植的作物有谷子、小麦、大麦、亚麻等。驯养的动物有狗、牛、羊等。巴达里人穿兽皮和亚麻缝制的衣服。他们是追求美的民族，往往佩带石珠、贝壳等装饰品。他们不分男女都十分喜爱化妆，保存下来不少的“调色板”。调色板（Palette）是埃及学上的一个专业术语，它是指中间带有一个凹洼的石板。古埃及人将绿松石等矿物放至石板凹洼处研磨，然后拌以油脂调和制成糊状物，抹涂眼眉，用于化妆。
涅伽达是埃及的一个现代村落，位于卢克索（Luxor）以北地区。考古学家在这里发现了不同层次的文化。根据最新研究成果，可以分成涅伽达文化I、涅伽达文化II、涅伽达文化III三个阶段。在涅伽达文化I时期，生产力虽然有了一定的发展，出现了专门化的燧石加工业，但是铜质工具仍然非常稀有。目前我们还不敢断定，涅伽达文化时期埃及与地中海地区已发生了贸易往来。不过，埃及与周边的西亚地区可能已经发生了商业往来。由于手工业和商业的发展，导致了城市的出现。涅伽达文化I时期埃及已经出现了城市居民。
涅伽达文化II时期仍处于铜石并用时代，这时，石器的加工技术有了进一步的提高，人们已经开发了尼罗河谷及沙漠地区的各种石灰石、雪花石、蛇纹石、玄武岩、闪长石等石料，金属器的使用进一步扩大。陶器的生产也大为改善，由于发明了陶轮，因而产品的数量大大提高。涅伽达文化II时期，上埃及形成了三大中心，分别是涅伽达、希拉康坡里斯和阿拜多斯。
彩绘陶罐，涅伽达文化II
涅伽达文化III时期是前王朝时期的最后一个阶段，正是在这个阶段，古代埃及第一次完成了统一，建立了统一的强大的国家。希拉康坡里斯逐渐发展成为最重要的政治中心。蝎子王的争霸，以及那尔迈的征服活动开创了古代埃及统一的新形势。