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肾具有“主骨、生髓、通于脑”的功能。骨骼是人体的支架，主司人体的运动。骨骼还可以支撑、保护人体结构。但骨骼并不是孤立的，需要靠骨髓来充养。《黄帝内经》将髓分为三种：脑髓、骨髓、脊髓。这三种髓都是由肾精所化生的。肾中精气的盛衰影响到骨的生长与发育，进而影响到髓的充盈与功能。
简而言之，肾精能够生髓，而髓能养骨，故称“肾主骨”。
中医认为，脑为髓的聚集之处，故称“肾主骨生髓，脑为髓之海”，这就是说，肾能藏精，而精又能化生髓；髓居骨中，骨靠髓来充养，而髓又聚汇于脑。因此，脑髓也依赖于肾精的充养。《黄帝内经》总结道：“肾生骨髓”，“肾不生则髓不能满”。
一个人的肾气充足，则骨质坚固、健康强壮；精足髓充，则头脑灵敏、心思精巧。这是因为，肾精充足，则骨髓和脑髓化生有源，骨质得到充足的营养。肾气充足，幼儿和青少年则骨骼发育健康，生长发育正常，头脑聪明；成年人则骨质致密，不易得病，精力充沛；老年人则骨骼不易老化，精神矍铄。
如果肾精亏虚，骨髓就会“化生无源”，骨骼失其滋养，产生很多问题。幼儿和青少年肾气不足，骨骼发育不良，生长迟缓；成年人则免疫力低，精神委靡不振，腰膝酸软，容易得病；老年人骨骼脆弱，骨质疏松，步履蹒跚，行走无力，耳聋眼花。
牙齿也与肾有关。中医认为，“齿为骨之余”，齿与骨同出一源，牙齿自然由肾中精气所充养。牙齿的生长与脱落，与肾中精气的盛衰密切相关。肾中精气充沛，则牙齿坚固而不易脱落；肾中精气不足，则牙齿易于松动，甚至过早脱落。
此外，肾气不足的人脑髓营养不足，脑子容易空虚，迟钝健忘。脑力工作者需要补充肾气，就是因为肾主骨生髓，肾精不足则脑力不足，思维迟钝，工作效率自然低下。而肾气充足的人，记忆力强、思维活跃，工作效率自然就高。因此，骨骼出现问题、容易骨折的人以及患有慢性神经衰弱病症的人，都可以尝试补肾益肾。
